由科技部、财政部联合制定的《关于深化中央财政科技计划（专项、基金等）管理改革的方案》，已经党中央、国务院批准。根据方案，中央财政科技计划将整合形成五类，政府不再直接管理具体项目，依托专业机构来具体管理。
根据《方案》，中央各部门管理的科技计划（专项、基金等）整合形成五类科技计划（专项、基金等）。新的科技计划（专项、基金等）体系，主要包括五个方面，即：国家自然科学基金、国家科技重大专项、国家重点研发计划、技术创新引导专项（基金）和基地与人才专项。
国家重点研发计划的设立，是《方案》的亮点和重大改革举措。据介绍，科技人员熟知的国家重点基础研究发展计划（“973”）、国家高技术研究发展计划（“863”）、国家科技支撑计划，以及国际科技合作与交流专项，发改委、工信部共同管理的产业技术研究与开发资金，农业部、卫计委等10多个部门管理的公益性行业科研专项等，都将纳入重点研发计划。
《方案》还提出，要建立公开统一的国家科技管理平台。各部门通过统一的科技管理平台，构建决策、咨询、执行、评价、监管等各环节职责清晰、协调衔接的新管理体系。
此外，根据《方案》，本次科技计划（专项、基金等）优化整合工作将按照整体设计、试点先行、逐步推进的原则开展。2015―2016年，基本建成公开统一的国家科技管理平台，基本完成各类科技计划（专项、基金等）的优化整合，实现科技计划（专项、基金等）安排和预算配置的统筹协调；2017年，全面按照优化整合后的五类科技计划（专项、基金等）运行，现有各类科技计划（专项、基金等）经费渠道将不再保留。